《黄帝内经》（以下简称《内经》）是我国最早的医籍，包括《素问》和《灵枢》两部分，今本各八十一篇。《内经》的体例以语录体为主，记载黄帝与岐伯的问对。所谓“岐黄之术”一词就是来源于《内经》中二人对于医学原理的探讨，代指医术。
医家祖师｜神话与巫术黄帝与岐伯是传说中的人物，古代其他史籍中有关医家祖师的记载也有一定的神话和巫术色彩。如与黄帝同时的俞跗，相传是黄帝的臣子。《韩诗外传》记载：“俞跗之为医也，榒木为脑。芷草为躯，吹窍定脑，死者更生。”（韩婴著，赖炎元注译《韩诗外传今注今释》，台湾商务印书馆年版，第页。）再如《史记·扁鹊仓公列传》中记载扁鹊得长桑君所传医方，嘱咐扁鹊“饮是以上池之水，三十日当知物矣。”扁鹊依言而行，此后竟能“视见垣一方人”，视病人则能“尽见五脏症结”。（司马迁《史记》第九册，中华书局年版，第页。）这些记载都是远古时期巫医同源的证明。
在我国现存最早的目录书《汉书·艺文志》中有关于该书的著录：“《黄帝内经》十八卷”，隶属“方技略”“医经”类。（班固《汉书》第六册，中华书局年版，第页。）书籍托名黄帝，实际上不可能是黄帝一人所作，而是历代医师总结医学相关知识，累次增削，最终才呈现出今天所看到的面貌。明代医学家吕复即认为该书：“观其意旨，殆非一时之言。及其撰述，亦非一人之手。”我国历来有“托古自重”的传统，书籍领域也不例外。从《汉书·艺文志》中可以看出，书籍越古则托名现象越严重。尤其是“神仙”类典籍，动辙神农黄帝，实则书成众手。
释名《素问》、《灵枢》
《内经》作为最早的医籍，问世之后得以广泛流传，历代都不乏优秀的注本。《素问》前有唐宝应年间王冰序，《灵枢》前有宋绍兴年间史崧序。序中提出：“古人有言曰：为人子而不读医书，犹不孝也。”这种观念极大地推动了《内经》等医籍的传播。同时，由于《内经》的重要地位，从汉代开始即受到医家的重视，张仲景《伤寒杂病论》、王叔和《脉经》等的撰写都曾借鉴《内经》。
“素问”之名，“著于《隋志》上，见于汉代也。”“素问”之意，宋代校正后序言给出了两种解释。其一引全元起（隋代医家，最早为《素问》作注解的人。）释义：“素者，本也。问者，黄帝问岐伯也。方陈性情之源，五行之本，故曰素问。”杨亿等校正者认为此解不甚明朗，遂引《易纬·乾凿度》中语：“夫有形者生于无形，故有太易、有太初、有太始、有太素。太易者，未见气也；太初者，气之始也；太始者，形之始也；太素者，质之始也。”又说：“气形质具而疴瘵由是萌生，故黄帝问此。太素，质之始也。素问之名义或由此。”后一种解释与道家纬书理论结合得更加紧密，且更加明确。至于“灵枢”之名，则依据字面意思解释为“神灵之枢要”（张介宾释义）即可。
《内经》不同的版本系统卷数有很大的差异。这是由于古书是以单篇形式编订的，后世逐渐排定篇目，增补篇次，重新校订，加入注释，如此就会形成不同的版本系统。时代不同，编订者所起的书名也不同，这就是“同书异本”现象。后世医家对典籍的理解不同，则随文附写的注解也不同，由此形成多种多样的版本系统。越是重要的典籍，其版本系统往往越复杂。从目录学史的角度来关照，经学书籍，也就是“六艺略”所统御的书籍这个现象尤其明显，《内经》作为医籍中的经书，其版本系统复杂多样也是势所必然的。
魏晋时医家皇普谧把《内经》叫做《甲乙经》，包括《针经》和《素问》两部分，《针经》也就是今本的《灵枢》部分。注解形式一般是大字为正文，小字为注释。如此，注释内容越多则注本的卷数越多，如隋唐间杨上善有《黄帝内经太素》三十卷，明代张介宾有《类经》三十二卷，马莳有《素问注证发微》和《灵枢注证发微》各九卷，吴昆有《素问吴注》二十四卷，清张志聪有《黄帝内经素问集注》和《黄帝内经灵枢集注》各九卷。《内经》传到海外，在周边国家也引起了广泛