吕不韦到底是不是秦始皇的生父，这个争议之所以存在两千多年，其根源来自于司马迁在《秦始皇本纪》和《吕不韦列传》中不同的记载。与此同时，秦始皇生母赵姬原来吕不韦歌姬的身份，以及后来两人之间的私情，更是让这个争议变得扑朔迷离。那么，吕不韦到底是不是秦始皇的亲生父亲呢？个人认为大概率不是。
关于秦始皇生父之谜，根源在于司马迁的记载冲突
被誉为“史家之绝唱，无韵之《离骚》”的《史记》，在正史中的地位极高，但也正因如此，由于司马迁在《秦始皇本纪》和《吕不韦列传》中不同的记载，导致秦始皇的身世变得扑朔迷离。
《史记·秦始皇本纪》开篇便写道，“秦始皇帝者，秦庄襄王子也。庄襄王为秦质子於赵，见吕不韦姬，悦而取之，生始皇”。从这段记载来看，司马迁根本没有怀疑秦始皇的身世，很明确的记载秦始皇乃秦庄襄王之子。
然而到了《史记·吕不韦列传》，司马迁却写道，“吕不韦取邯郸诸姬绝好善舞者与居，知有身。子楚从不韦饮，见而说之，因起为寿，请之。吕不韦怒，念业已破家为子楚，欲以钓奇，乃遂献其姬。姬自匿有身，至大期时，生子政。”意思是说，异人向吕不韦求取赵姬之时，吕不韦最初极为恼怒，后考虑到自己身家已经全部压在了异人身上，这才将赵姬献给异人。而赵姬也隐瞒了其已经怀孕的事实，嫁给异人之后，生下秦始皇。
如上所述，秦始皇的身世之谜流传了两千多年，根源便在于司马迁在《史记》中不同的记载，再加上赵姬与吕不韦之间混乱的关系，导致吕不韦是秦始皇生父之说一度甚嚣尘上。不过，个人认为秦始皇应当是异人之子无疑，主要有以下几点原因。
原因之一：《史记》记载虽然不同，但“本纪”可信度高于“列传”
为何同一件事，在《史记》之中却出现不同的记载，其实最主要还是源于司马迁的严谨。由于司马迁撰写《史记》之时，史料来源极为庞杂，加上距离某些历史事件时间太过久远，即使司马迁也难以分辨其中真伪。
现代普遍认为，司马迁为了确保史料的完整性，遂将自己认为最可信的史料，用于“本纪”和“表”的撰述，而将可信度较低的说法，则保留在了列传之中，甚至将互相矛盾的史料并列于一处，留下让人思考和回味的隐语。
其实仔细翻阅《史记》，便不难发现一个有趣的特点，“本纪”中的叙述大多为陈述历史事件，重点突出对历史事件的记载；而“列传”之中的记载则丰富了很多，大量穿插着人物对话和事件细节描述，读之仿佛让人身临其境一般。
我们反过来思考，由于先秦史料的丢失，很多历史事件的原貌已经很难完全还原，尤其是很多私密性很强的对话，以司马迁一个后世人来说，更是难以得知，因此其中免不了文学创作。
正如秦始皇的身世，《秦始皇本纪》中只是对其身世做了陈述，而《吕不韦列传》则较为丰富的还原了当时的场景，事实上吕不韦当时是否真的发怒，后世的司马迁怎么可能知道。不过，这些坊间的传闻趣事，尽管可信度较低，但删去又未免可惜，因而司马迁便用隐喻和矛盾的笔法，以异闻异事的形式将不同来源的史料保存了下来。
如上，“本纪”记载的可信度无疑要比“列传”高很多，而当“本纪”和“列传”记载出现冲突时，通常采用“本纪”的记载，而“列传”的说法则更多为趣谈。
原因之二：“列传”记载不合常理，而汉朝前无人怀疑其身世
受“宗法制”影响，古人对于血统问题极为重视，尤其是王位传承这种大事，根本容不得半点马虎。如果秦始皇的血统真的存在问题，哪怕是有一丝可疑之处，其即位的可能性都几乎为零。
如果真如《史记·吕不韦列传》所载，赵姬“至大期时，生子政”，那么秦始皇的血统便存在着巨大疑点。“期”古音为“jī”，指一周年或指妇女足月分娩的日期。我们分别来分析：
“期”指一周年：即赵姬嫁给异人一周年后生下嬴政，如果赵姬真的在嫁给异人之前便已经怀孕，那么她的妊娠期将达十二个月以上。而现代医学表明，女性足月妊娠约为天（40周），即使时间较长，也不过44周，即十个月左右。当然，超过这个时间的并非没有，只是概率极小，难道赵姬真的是那极少数之一吗？“期”指足月分娩：如果赵姬是足月生下的嬴政，而她在嫁给异人之前已经怀孕，那么也就是说，赵姬在嫁给异人不到十个月的情况下，便生下了秦始皇，这显然也不符合常理，岂能不引起他人怀疑？如上，无论这里的“期”是什么意思，“列传”的记载要么不符合生理，要么不符合常理，都足以引起他人怀疑。
要知道，在秦始皇返回秦国之前，异人已经在秦国另行娶妻生子，如果秦始皇的身世真的存在疑点，由于事关王室血脉，他是必然不能被立为继承人的，即使有吕不韦的帮助也不太可能。然而，事实上在汉朝之前，嬴政从出生到其被立为继承人，再到其继承王位位置，始终没有人对其身世产生怀疑，甚至连一丝流言蜚语都没有出现。
原因之三：吕不韦没有动机，王室血脉乃其投资关键
在遇到吕不韦之前，由于异人母子均不受安国君的宠爱，再加上安国君有儿子多达二十多人，异人可以说没有丝毫继位的可能，否则也不太会被送往赵国邯郸作为质子。而吕不韦之所以认为异人“奇货可居”，主要看中的就是异人的秦国宗室身份。
要知道，吕不韦为了让异人顺利继位，不仅将全部身家压了上去，而且可以说费尽了心思。他先是将互惠互补，双赢共利的商业原则运用于政治，通过连环套式的投资计划，促成了子楚与华阳夫人联手合作。同时，吕不韦之所以能够成功游说华阳夫人与异人联手，表面上看来复杂而富有戏剧性，其实质则是嬴姓某系王子与芈氏外戚之间再次缔结政治同盟。
而吕不韦这一系列操作的关键，便是异人及其子孙的血统问题，而一旦嬴政的血统出现问题，即使吕不韦有翻天的本事，也根本没有办法将异人扶上王位。因此，对于吕不韦来说，维护秦王血统的纯正和可信，乃是其最为首要的问题，他不敢有丝毫的懈怠，他岂会在这一问题上犯糊涂，恐怕避嫌还来不及。
有人或许会说，吕不韦难道不是想通过将自己的儿子扶上王位，从而实现谋国之举吗？个人认为不太可能。首先，与《吕不韦列传》记载冲突，如果吕不韦真的有此野心，那么在异人看中已经怀孕的赵姬后，吕不韦又为何要发怒呢？这岂不是正中下怀，他难道不应该欣喜若狂的将赵姬送给异人吗？
其次，吕不韦不是傻子，就算秦始皇真的是他的儿子，他也有能力将嬴政扶上王位，他难道不想想，坐上王位的嬴政，真的会因为他的一句话，就认回他这个父亲？除非嬴政想要国内大乱。而如果嬴政不认，吕不韦的这一系列操作岂不是竹篮打水一场空？
如上所述，吕不韦根本没有动机将怀孕的赵姬献给异人，否则一旦秦始皇的血统问题被发现，那么不仅他的所有投资都将化为乌有，甚至连他本人和秦始皇，以及吕氏家族的性命都很难保证。事实上，吕不韦只是个寻求政治投机的商人，而不是个意图谋朝篡位的野心家。
综上所述，个人认为秦始皇的身世应该不存在问题，秦始皇的生父应当就是秦庄襄王异人无疑。此外，关于秦始皇的身世争议，大多来源于汉代以后，这恐怕有着太多的政治因素在内。